RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH2Q12809 1159 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MEA1Q16626 185 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD1Q96MW7 591 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP9Q9H5L6 903 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVM2 712 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TCAF2A6NFQ2 919 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP6P22004 513 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPCQ03188 943 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT2A1Q06520 285 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 OXR1Q8N573 874 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52K2Q8NGK3 314 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NELFBQ8WX92 580 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG14Q96F25 216 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MED15Q96RN5 788 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM204AQ9H8W3 233 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A4O43246 635 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MED7O43513 233 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IRAK1P51617 712 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCLQ13371 301 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 POM121L1PQ3SYA9 428 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 AGBL4Q5VU57 503 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8D1Q8WZ84 308 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM4CQ9H3R0 1056 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 AK5Q9Y6K8 562 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP12O43422 761 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SDC3O75056 442 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R2P41236 205 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTN1Q12860 1018 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RTP5Q14D33 572 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RABGAP1LQ5R372 815 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL22Q6P050 247 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DSG4Q86SJ6 1040 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCHQ86VS3 1027 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM69Q86WT6 500 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NRSN2Q9GZP1 204 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DDIT4Q9NX09 232 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 COX16Q9P0S2 106 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1HQ9ULR3 514 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 DMTF1Q9Y222 760 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CA5BQ9Y2D0 317 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP9BO43861 1147 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CKMT2P17540 419 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 GNA15P30679 374 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 VASPP50552 380 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ILKQ13418 452 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 ACCSLQ4AC99 568 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM46CQ5VWP2 391 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZVU0 165 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB106AQ8N104 65 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR1P32246 355 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 GGCXP38435 758 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MARSP56192 900 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 STX17P56962 302 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK17Q00537 523 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 FEM1AQ9BSK4 669 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A13Q9UJS0 675 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51B4Q9Y5P0 310 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 BICDL2A1A5D9 508 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PRB1P04280 392 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A3P11169 496 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT1P36639 197 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OXCT1P55809 520 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 OVGP1Q12889 678 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 AUHQ13825 339 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT4Q14765 748 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 DLG2Q15700 870 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PROX2Q3B8N5 592 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 GJB7Q6PEY0 223 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF34Q969K3 372 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 CPXM1Q96SM3 734 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 PRORYQ9H606 182 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 VANGL2Q9ULK5 521 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 RAI2Q9Y5P3 530 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 BECN2A8MW95 431 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM38O00635 465 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MCF2LO15068 1137 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEC1O60732 1142 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAP2O75791 330 aa26.35■■□□□ 1.81
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