RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM17P78536 824 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GRAPQ13588 217 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RIN1Q13671 783 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP2R5BQ15173 497 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMK4Q16566 473 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ARTNQ5T4W7 220 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NAA35Q5VZE5 725 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ADALQ6DHV7 355 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MCTP2Q6DN12 878 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RINLQ6ZS11 566 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM83AQ86UY5 434 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCA1Q86XH1 822 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FSIP1Q8NA03 581 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CNBD1Q8NA66 436 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPAQ9BY32 194 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SPON1Q9HCB6 807 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NFU1Q9UMS0 254 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PSAT1Q9Y617 370 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 XDHP47989 1333 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 AP3D1O14617 1153 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CBFA2T3O75081 653 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SCGB1D1O95968 90 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT1P04264 644 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GCSHP23434 173 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 UQCRC1P31930 480 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR7P34969 479 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS2P41220 211 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PAFAH1B1P43034 410 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PGDP52209 483 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CHN2P52757 468 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTO1P78417 241 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MECOMQ03112 1051 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF844Q08AG5 666 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SSPNQ14714 243 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC23BQ15437 767 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NFIL3Q16649 462 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR5LQ6MZQ0 368 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM111BQ6SJ93 734 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PXKQ7Z7A4 578 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC71Q8N4P6 559 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM171Q8WVE6 324 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CUL5Q93034 780 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
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