RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT83P78385 493 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SULT2A1Q06520 285 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ENPP2Q13822 863 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MESDQ14696 234 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ACAP1Q15027 740 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 IL31Q6EBC2 164 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 KBTBD6Q86V97 674 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 RASSF3Q86WH2 238 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 DCLK2Q8N568 766 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB119Q8N690 84 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 OR7D4Q8NG98 312 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 GAB3Q8WWW8 586 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPH1Q92598 858 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO19Q96H55 970 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PEBP4Q96S96 227 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PSMB7Q99436 277 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 EPAS1Q99814 870 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 USP18Q9UMW8 372 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ILVBLA1L0T0 632 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR23AA6NEV1 266 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 K7ERQ8 282 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 GFRA3O60609 400 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SIN3BO75182 1162 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MT-CO1P00395 513 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM253P0C7T8 217 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 RARAP10276 462 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ACADMP11310 421 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 VAV1P15498 845 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 GOT1P17174 413 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 BCKDHBP21953 392 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 AMPD1P23109 780 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 GLDCP23378 1020 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 IL1R2P27930 398 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PCK1P35558 622 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 GJC1P36383 396 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ACVRL1P37023 503 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 COPAP53621 1224 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 AIF1P55008 147 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TPI1P60174 286 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 GNA12Q03113 381 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SCAPQ12770 1279 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CKAP5Q14008 2032 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 DLG2Q15700 870 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 BOLA3Q53S33 107 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MANEALQ5VSG8 457 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 LINGO4Q6UY18 593 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM124AQ86V42 546 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP14Q86W24 1093 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CACUL1Q86Y37 369 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 STK40Q8N2I9 435 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRN2Q92932 1015 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PANX2Q96RD6 677 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms