RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585794.5

EFTUD2-204, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-204ENST00000585794 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 KLK6Q92876 244 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 IFT43Q96FT9 208 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CLIC6Q96NY7 704 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 PANK2Q9BZ23 570 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 FZD3Q9NPG1 666 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 UNC13CQ8NB66 2214 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 MUSKO15146 869 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 IRAK2O43187 625 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 EXOC3O60645 756 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ZBED1O96006 694 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 LIPCP11150 499 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 UGT1A5P35504 534 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 TXLNAP40222 546 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 STAT6P42226 847 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CLDN2P57739 230 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 DLG4P78352 724 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CNTN1Q12860 1018 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NCAPHQ15003 741 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 JAMLQ86YT9 394 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 APCDD1Q8J025 514 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 RNF139Q8WU17 664 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 EDEM1Q92611 657 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 TAF4BQ92750 862 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SPAG5Q96R06 1193 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 PREBQ9HCU5 417 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 A0A1W2PQU0 124 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ACSL4O60488 711 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 IGLV3-27P01718 113 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CSF2P04141 144 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 HGFP14210 728 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CD58P19256 250 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SLC11A2P49281 568 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NUMBP49757 651 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CDH18Q13634 790 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SPIDRQ14159 915 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 FZD2Q14332 565 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 NR0B2Q15466 257 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ZNF284Q2VY69 593 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ZNF394Q53GI3 561 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 Q6ZSR6 202 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SV2AQ7L0J3 742 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 WDR48Q8TAF3 677 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 FRS2Q8WU20 508 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 GPR27Q9NS67 375 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 KLF15Q9UIH9 416 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 PLAAQ9Y263 795 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CEP83Q9Y592 693 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 CLIC4Q9Y696 253 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-204ENST00000585794 MED13Q9UHV7 2174 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-204ENST00000585794 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-204ENST00000585794 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-204ENST00000585794 E7ENQ6 273 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms