RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINF2P08697 491 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ENGP17813 658 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 OR1E1P30953 314 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 HOXD12P35452 270 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CDH4P55283 916 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 KRT83P78385 493 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB16Q05516 673 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 KDM1BQ8NB78 822 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 NT5C3BQ969T7 300 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 HAPLN3Q96S86 360 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SPON2Q9BUD6 331 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PP55 124 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 E9PAM4 449 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MID1O15344 667 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CNTN5O94779 1100 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 FSBPO95073 299 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA4FO95754 770 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 IL1BP01584 269 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SYPP08247 313 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 DESP17661 470 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SLC8A1P32418 973 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ACSL1P33121 698 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD8P48556 350 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 IRAK1P51617 712 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 PLK1P53350 603 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CST6Q15828 149 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ASIC2Q16515 512 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC14Q49A88 953 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ALFQ53S48 1182 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 TRNP1Q6NT89 227 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ARCQ7LC44 396 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 STK40Q8N2I9 435 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRN2Q92932 1015 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MYO19Q96H55 970 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf74Q96LT6 269 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SGK2Q9HBY8 427 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 MPP6Q9NZW5 540 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SCML1Q9UN30 329 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CACNA1EQ15878 2313 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GTW7 788 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQC6 194 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC53A6NM62 1247 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 DRGXA6NNA5 263 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP33O14559 1287 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 OPHN1O60890 802 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ENDOD1O94919 500 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-19P01714 112 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 GPD1P21695 349 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 ADRA1BP35368 520 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 UBASH3AP57075 661 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 NR1I3Q14994 352 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRM-214ENST00000583153 IQCB1Q15051 598 aa8.54□□□□□ -1.04
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