RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 DMXL1Q9Y485 3027 aa21.64■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.055e-15■■■□□ 14.9
SNAP23-216ENST00000568331 ITPKAP23677 461 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ACCSLQ4AC99 568 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 FAM124AQ86V42 546 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ALG14Q96F25 216 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 GPR174Q9BXC1 333 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SCML1Q9UN30 329 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.63■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 IGLV3-19P01714 112 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SERPING1P05155 500 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 HOXD12P35452 270 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 MAMLD1Q13495 774 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 EFHC2Q5JST6 749 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC185Q8N715 623 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RNF214Q8ND24 703 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 GANCQ8TET4 914 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 NTAN1Q96AB6 310 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SCINQ9Y6U3 715 aa21.62■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 MEI4A8MW99 385 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 GDF9O60383 454 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 TMC6Q7Z403 805 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 DRC7Q8IY82 874 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CEP76Q8TAP6 659 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 TCEAL3Q969E4 200 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF653Q96CK0 615 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 TBC1D31Q96DN5 1066 aa21.61■■□□□ 1.05
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SNAP23-216ENST00000568331 AIF1P55008 147 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CST6Q15828 149 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 HGSNATQ68CP4 663 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RTKNQ9BST9 563 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SPON2Q9BUD6 331 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PATE3B3GLJ2 98 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ATP9BO43861 1147 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CFIP05156 583 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 C7P10643 843 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 RHOQP17081 205 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 CASP14P31944 242 aa21.59■■□□□ 1.05
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SNAP23-216ENST00000568331 TRIM14Q14142 442 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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SNAP23-216ENST00000568331 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.59■■□□□ 1.05
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SNAP23-216ENST00000568331 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 STK40Q8N2I9 435 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PTPRN2Q92932 1015 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 EDEM2Q9BV94 578 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 ISCUQ9H1K1 167 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 VPS51Q9UID3 782 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP23-216ENST00000568331 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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