RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 OLFML3Q9NRN5 406 aa10.01□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 STMND1H3BQB6 276 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 AGRPO00253 132 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 TPP1O14773 563 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 IRAK2O43187 625 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CNTN5O94779 1100 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 DDAH2O95865 285 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CSF2P04141 144 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ANXA6P08133 673 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PRR29P0C7W0 189 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SLC11A2P49281 568 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CASP5P51878 434 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PDX1P52945 283 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SLC8A3P57103 927 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PSMD6Q15008 389 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZSR6 202 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SV2AQ7L0J3 742 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 FIBINQ8TAL6 211 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC5Q8TCV5 224 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 RNF34Q969K3 372 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CMKLR1Q99788 373 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 FOXP3Q9BZS1 431 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 DYRK4Q9NR20 520 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SPASTQ9UBP0 616 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC39Q9UFE4 941 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PADI4Q9UM07 663 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 DOLKQ9UPQ8 538 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ITIH6Q6UXX5 1313 aa10□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PQU0 124 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 D6RAR5 112 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 JUNDP17535 347 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ITIH1P19827 911 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 GNLYP22749 145 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SLC6A4P31645 630 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 UQCRFS1P47985 274 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SGSHP51688 502 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 MLLT10P55197 1068 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CLDN2P57739 230 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ANAPC15P60006 121 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 NCOA4Q13772 614 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 NEK5Q6P3R8 708 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SV2BQ7L1I2 683 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PTPRN2Q92932 1015 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 USP7Q93009 1102 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 STK17AQ9UEE5 414 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 GGT7Q9UJ14 662 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 RELNP78509 3460 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PRR19A6NJB7 356 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 EFCAB7A8K855 629 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PCDH8O95206 1070 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 COL8A1P27658 744 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CCKBRP32239 447 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 TXLNAP40222 546 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CYP2J2P51589 502 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 NEK4P51957 841 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 AP3M2P53677 418 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CYP24A1Q07973 514 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CNTN1Q12860 1018 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ACCSLQ4AC99 568 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 AGBL4Q5VU57 503 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SMAD3-211ENST00000559460 HORMAD1Q86X24 394 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms