RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554490.1

AC005519.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005519.1, Length 601 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005519.1-201ENST00000554490 NENFQ9UMX5 172 aa6.86□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.86□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TMEM131Q92545 1883 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SPTBN2O15020 2390 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 A0A0D9SEW6 157 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 LNP1A1A4G5 178 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ILVBLA1L0T0 632 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FAM72CH0Y354 149 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 MAP3K13O43283 966 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 CBFA2T2O43439 604 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ATP9BO43861 1147 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SNAP91O60641 907 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SRGAP2O75044 1071 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 RTN2O75298 545 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 LRIG2O94898 1065 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 MYBL1P10243 752 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ACADMP11310 421 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 VAV1P15498 845 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ITPKAP23677 461 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 PSMA2P25787 234 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 OR1E1P30953 314 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 HOXD12P35452 270 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 AIF1P55008 147 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ZBTB16Q05516 673 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SEMA3BQ13214 749 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TRIM14Q14142 442 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 EFHC2Q5JST6 749 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 LRRC31Q6UY01 552 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FAM72BQ86X60 149 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 VSTM4Q8IW00 320 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 OR7D4Q8NG98 312 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 PTPRN2Q92932 1015 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ZNF653Q96CK0 615 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 RMDN1Q96DB5 314 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TRIM11Q96F44 468 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 PEBP4Q96S96 227 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 DNAJC7Q99615 494 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SUN2Q9UH99 717 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 VPS51Q9UID3 782 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FZD10Q9ULW2 581 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SCINQ9Y6U3 715 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.85□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 A0A087X0T9 212 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 PATE3B3GLJ2 98 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 MID1O15344 667 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 GDF9O60383 454 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 MFAP3LO75121 409 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 LRCH4O75427 683 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 ZMPSTE24O75844 475 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 DNTTP04053 509 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 FAM228BP0C875 321 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 SRCP12931 536 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 RHOQP17081 205 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 DESP17661 470 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 GLDCP23378 1020 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 OXTRP30559 389 aa6.84□□□□□ -1.31
AC005519.1-201ENST00000554490 L1CAMP32004 1257 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms