RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 LILRA4P59901 499 aa7.4□□□□□ -1.22
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GNPTAB-209ENST00000552009 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 CENPPQ6IPU0 288 aa7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 GAREM2Q75VX8 874 aa7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 SFR1Q86XK3 245 aa7.4□□□□□ -1.22
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GNPTAB-209ENST00000552009 BEST2Q8NFU1 509 aa7.4□□□□□ -1.22
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GNPTAB-209ENST00000552009 FIZ1Q96SL8 496 aa7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 TIPINQ9BVW5 301 aa7.4□□□□□ -1.22
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GNPTAB-209ENST00000552009 PANK2Q9BZ23 570 aa7.4□□□□□ -1.22
GNPTAB-209ENST00000552009 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.4□□□□□ -1.22
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GNPTAB-209ENST00000552009 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.4□□□□□ -1.22
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GNPTAB-209ENST00000552009 TSC2P49815 1807 aa7.4□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM186AA6NE01 2351 aa7.4□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.39□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.39□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 OGTO15294 1046 aa7.39□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ODC1P11926 461 aa7.39□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ACVRL1P37023 503 aa7.39□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 PON2Q15165 354 aa7.39□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 DNASE1L2Q92874 299 aa7.39□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.39□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 ANTXRLA6NF34 631 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 OR6C75A6NL08 312 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 PIRO00625 290 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 CYB561D2O14569 222 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ARHGAP6O43182 974 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 SUV39H1O43463 412 aa7.38□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 IL13RA1P78552 427 aa7.38□□□□□ -1.23
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GNPTAB-209ENST00000552009 NRN1LQ496H8 165 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GNPTAB-209ENST00000552009 RTL10Q7L3V2 364 aa7.38□□□□□ -1.23
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