RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 RNF103O00237 685 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ACSL4O60488 711 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 PPFIA2O75334 1257 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 E2F4Q16254 413 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 BRAPQ7Z569 592 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 RNF139Q8WU17 664 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TATDN2Q93075 761 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 USP29Q9HBJ7 922 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 A0A1W2PQU0 124 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 MUSKO15146 869 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 SLC7A4O43246 635 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 GABBR2O75899 941 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 NUDT1P36639 197 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ADIGQ0VDE8 80 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 FZD2Q14332 565 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ZNF284Q2VY69 593 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 C14orf80Q86SX3 495 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 JAMLQ86YT9 394 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TNMDQ9H2S6 317 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 DMAC2Q9NW81 257 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 CEP83Q9Y592 693 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 NEMP2A6NFY4 417 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 AGRPO00253 132 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TCEA3O75764 348 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 UGT1A5P35504 534 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 RAD23BP54727 409 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 CDH18Q13634 790 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 DCAF6Q58WW2 860 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 Q6ZSR6 202 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 TMX3Q96JJ7 454 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 BMFQ96LC9 184 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 SPAG5Q96R06 1193 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 BACH2Q9BYV9 841 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 GPR27Q9NS67 375 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-230ENST00000551968 PLD2O14939 933 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 IRAK2O43187 625 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SFTPCP11686 197 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SLC11A2P49281 568 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LRBAP50851 2863 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 POM121BA6NF01 834 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PIK3R2O00459 728 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 RAD51BO15315 384 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SPINT1O43278 529 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CSF2P04141 144 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CTSLP07711 333 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TRIM49P0CI25 452 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TRIM49CP0CI26 452 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LIPCP11150 499 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 GCLMP48507 274 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 INHBCP55103 352 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TBX4P57082 545 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms