RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 ABI1Q8IZP0 508 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SCML4Q8N228 414 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 CPT1BQ92523 772 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SEPT8Q92599 483 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 APBB2Q92870 758 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 NTAN1Q96AB6 310 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 KLHL29Q96CT2 875 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 RTP4Q96DX8 246 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ZNF333Q96JL9 665 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 TTC25Q96NG3 672 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SLC9A7Q96T83 725 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 USP29Q9HBJ7 922 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PIGVQ9NUD9 493 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 COX16Q9P0S2 106 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 USP3Q9Y6I4 520 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SMIM23A6NLE4 172 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 H3BRJ5 948 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SYN3O14994 580 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 TADA2AO75478 443 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 TCEA3O75764 348 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ATP5HO75947 161 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 OAZ2O95190 189 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 AGTP01019 485 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PDHA1P08559 390 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ABHD2P08910 425 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PTPN2P17706 415 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 FUT4P22083 530 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 AMPD1P23109 780 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 RBL1P28749 1068 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 VHLP40337 213 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ARL4CP56559 192 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 GBE1Q04446 702 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SCAPQ12770 1279 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SEPT6Q14141 434 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 MTFR1Q15390 333 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 HIF1AQ16665 826 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 LIN52Q52LA3 116 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 RASIP1Q5U651 963 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 BEND5Q7L4P6 421 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 RNF139Q8WU17 664 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SKA1Q96BD8 255 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 C9orf72Q96LT7 481 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 CASD1Q96PB1 797 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 DEFB118Q96PH6 123 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 13.5
CS-204ENST00000546621 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 DRC3Q9H069 523 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ECT2Q9H8V3 914 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 PAK5Q9P286 719 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 STOML1Q9UBI4 398 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-204ENST00000546621 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 137.9
CS-204ENST00000546621 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 HACD1B0YJ81 288 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 ALOX15BO15296 676 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 CHADO15335 359 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-204ENST00000546621 HOXA2O43364 376 aa7.96□□□□□ -1.14
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