RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ABCG1	P45844	678 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SLC11A1	P49279	550 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	DSC1	Q08554	894 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	COL6A1	P12109	1028 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ELF1	P32519	619 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	RASSF2	P50749	326 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TPP1	O14773	563 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PAM	P19021	973 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	STX3	Q13277	289 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MPP3	Q13368	585 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MECR	Q9BV79	373 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SCML2	Q9UQR0	700 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	GLRA3	O75311	464 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	AMH	P03971	560 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	GSTA1	P08263	222 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	CCNC	P24863	283 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MAP2K2	P36507	400 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	APLP1	P51693	650 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	HTRA3	P83110	453 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	LHX8	Q68G74	356 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	CPNE1	Q99829	537 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.75	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TLR5	O60602	858 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	NBN	O60934	754 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	RENBP	P51606	427 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PRMT2	P55345	433 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	VEGFB	P49765	207 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PSEN1	P49768	467 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	FAM189B	P81408	668 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	NAB1	Q13506	487 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF235	Q14590	738 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	GRTP1	Q5TC63	336 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
DDX11-208	ENST00000536265	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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