RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 CRYMQ14894 314 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM117BQ6P1L5 589 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 CES3Q6UWW8 571 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 CDKL2Q92772 493 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 APOL2Q9BQE5 337 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 ZYG11BQ9C0D3 744 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 CCSER2Q9H7U1 834 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1-204ENST00000519651 SNX3O60493 162 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TUFMP49411 452 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SH2D5Q6ZV89 423 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 OTUD6BQ8N6M0 293 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 VN1R3Q9BXE9 311 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC40Q9H9A6 602 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CASS4Q9NQ75 786 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 WASH4PA8MWX3 477 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP9BO43861 1147 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 EFEMP2O95967 443 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC18A2Q05940 514 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 BMPR2Q13873 1038 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 MROH9Q5TGP6 573 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 RAP1GAP2Q684P5 730 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SPATA22Q8NHS9 363 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TOP1MTQ969P6 601 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 VWCEQ96DN2 955 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 PITPNM3Q9BZ71 974 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 BACE2Q9Y5Z0 518 aa17.89■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SHROOM3Q8TF72 1996 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 PLXNA3P51805 1871 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 NEBLO76041 1014 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CNTN5O94779 1100 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CLTBP09497 229 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 RHOQP17081 205 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ADRA1DP25100 572 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 DNAJC3Q13217 504 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 PDK4Q16654 411 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 AFMIDQ63HM1 303 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM47EQ6ZV65 393 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC49Q8IUZ0 686 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF683Q8IZ20 524 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 MTBPQ96DY7 904 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 APOPT1Q96IL0 206 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 IL12RB2Q99665 862 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.457e-7■■■■■ 27.3
TSNARE1-204ENST00000519651 DONSONQ9NYP3 566 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TANC1Q9C0D5 1861 aa17.88■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR91A4D1P6 747 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 PSMD3O43242 534 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CACNG3O60359 315 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SERPINB9P50453 376 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ALFQ53S48 1182 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CERCAMQ5T4B2 595 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXL22Q6P050 247 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CLSTN3Q9BQT9 956 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 COPEO14579 308 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TPH1P17752 444 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 NPY2RP49146 381 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CORO7P57737 925 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ITIH4Q14624 930 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC121Q6ZUS5 278 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SPOCK2Q92563 424 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 IGSF8Q969P0 613 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM169Q96HH4 297 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 FCRL5Q96RD9 977 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TTLL2Q9BWV7 592 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 GLOD4Q9HC38 313 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 FNIP2Q9P278 1114 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC17A6Q9P2U8 582 aa17.87■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 MYO1CO00159 1063 aa17.86■□□□□ 0.45
TSNARE1-204ENST00000519651 RFPL1O75677 317 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms