RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPPA5A6NC42 116 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNJ18B7U540 433 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOCS2O14508 198 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 EPN2O95208 641 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 TK1P04183 234 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSG1P11464 419 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 FCGR2AP12318 317 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 CPA1P15085 419 aa2.39□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 FSIP1Q8NA03 581 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPATA5Q8NB90 893 aa2.39□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 HERPUD2Q9BSE4 406 aa2.39□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 UPB1Q9UBR1 384 aa2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV2-30P06310 120 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 ACTR2P61160 394 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 LEXMQ3ZCV2 418 aa2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM171A1Q5VUB5 890 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 AWAT2Q6E213 333 aa2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 RFX8Q6ZV50 586 aa2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 RNFT2Q96EX2 444 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRMOQ9BU70 441 aa2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 HIPK3Q9H422 1215 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.38□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 NLKQ9UBE8 527 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANAPC4Q9UJX5 808 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 DERAQ9Y315 318 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.37□□□□□ -2.03
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RNU6-344P-201ENST00000516635 H0YGN5 161 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 H3BNX3 289 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 IRAK2O43187 625 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLK10O43240 276 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYP4B1P13584 511 aa2.37□□□□□ -2.03
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