RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516147.1

RNU6-617P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 617, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-617P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-617P-201ENST00000516147 ZFP57Q9NU63 452 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TMEM248Q9NWD8 314 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RGL1Q9NZL6 768 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TBC1D14Q9P2M4 693 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 KLQ9UEF7 1012 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PCDHA7Q9UN72 937 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SNX9Q9Y5X1 595 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 COL15A1P39059 1388 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 DYTNA2CJ06 578 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SLC38A8A6NNN8 435 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SMTNL1A8MU46 457 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RASA4BC9J798 803 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 H7C1Q1 480 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 KIR2DS3K7RE56 304 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TAF4O00268 1085 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PLOD2O00469 737 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SOCS6O14544 535 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 APOL1O14791 398 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SYN3O14994 580 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 MID1O15344 667 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 IRAK2O43187 625 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TGFB1I1O43294 461 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RASA4O43374 803 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PLPP2O43688 288 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 EXTL3O43909 919 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PIP5K1CO60331 668 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 LDB3O75112 727 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CBX6O95503 412 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CALCAP01258 141 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CYP1A2P05177 515 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SP1P08047 785 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PATE4P0C8F1 98 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CKMT1AP12532 417 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 MYOD1P15172 320 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 IL7RP16871 459 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CAPN2P17655 700 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CHRNB2P17787 502 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ATF3P18847 181 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RXRAP19793 462 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ITGAXP20702 1163 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ADRA1DP25100 572 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CNTFP26441 200 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 MAPK4P31152 587 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PRKAR1BP31321 381 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PTGER1P34995 402 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 GGT5P36269 586 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RGS2P41220 211 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 VIPR2P41587 438 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 MXI1P50539 228 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 DSCR10P59022 87 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 KRTAP10-1P60331 282 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RELQ04864 619 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CHRNDQ07001 517 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 DLG1Q12959 904 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 GPS1Q13098 491 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 MAPK7Q13164 816 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 KEAP1Q14145 624 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 POSTNQ15063 836 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PPP2R5AQ15172 486 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CNGA3Q16281 694 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 LPAL2Q16609 132 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ME3Q16798 604 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 DUSP6Q16828 381 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TBC1D25Q3MII6 688 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ARL13BQ3SXY8 428 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PHLDA2Q53GA4 152 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 XKR3Q5GH77 459 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 PLAC9Q5JTB6 97 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CERCAMQ5T4B2 595 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 FAM102BQ5T8I3 360 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 GFI1BQ5VTD9 330 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 DCAF12L2Q5VW00 463 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 TBC1D9BQ66K14 1250 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 NADSYN1Q6IA69 706 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CES5AQ6NT32 575 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 RINT1Q6NUQ1 792 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 WDR73Q6P4I2 378 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 BHLHB9Q6PI77 547 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 USP17L6PQ6QN14 398 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-617P-201ENST00000516147 SRLQ86TD4 932 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms