RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 KDM1BQ8NB78 822 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 MEIS3Q99687 375 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ARL15Q9NXU5 204 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 WNT16Q9UBV4 365 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 C4orf47A7E2U8 309 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ACTL6BO94805 426 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ARSBP15848 533 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PRPH2P23942 346 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CPT1BQ92523 772 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 OR6C75A6NL08 312 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CYP1A2P05177 515 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CPA1P15085 419 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 KLRC2P26717 231 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 EGR4Q05215 589 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CDK18Q07002 472 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 DCTN1Q14203 1278 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 RPS6KA2Q15349 733 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF585BQ52M93 769 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TTC22Q5TAA0 569 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TRILQ7L0X0 811 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 BICD2Q8TD16 824 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CTAGE1Q96RT6 745 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PIGSQ96S52 555 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 NDUFAF4Q9P032 175 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 BAG5Q9UL15 447 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 BECN2A8MW95 431 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TNFRSF8P28908 595 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TNFSF8P32971 234 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PNLIPRP1P54315 467 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ICA1Q05084 483 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 LTBQ06643 244 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 GALNTL6Q49A17 601 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 MTFR2Q6P444 385 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 Q6ZTK2 550 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC25Q86WR0 208 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 DPP10Q8N608 796 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 HIPK3Q9H422 1215 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-221ENST00000514231 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 GRM8O00222 908 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 SPRY3O43610 288 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 TGFB3P10600 412 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 SERPINA4P29622 427 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 ENTPD1P49961 510 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 CYP2J2P51589 502 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 SELENOVP59797 346 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 ZP1P60852 638 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 Q0VFX4 171 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 GPR18Q14330 331 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 DUSP6Q16828 381 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 FAM171A1Q5VUB5 890 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 ELP5Q8TE02 316 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-221ENST00000514231 NEUROG1Q92886 237 aa5.64□□□□□ -1.51
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