RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3HP0C7X1 549 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 DRD3P35462 400 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 CLCN1P35523 988 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 KRT9P35527 623 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 PPP2CAP67775 309 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 ACCSLQ4AC99 568 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 PKD1L2Q7Z442 2459 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 OR8D1Q8WZ84 308 aa17.4■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.4■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 GPSM3Q9Y4H4 160 aa17.4■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 TLR4O00206 839 aa17.39■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 LATO43561 262 aa17.39■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 CNTN1Q12860 1018 aa17.39■□□□□ 0.37
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HERC3-211ENST00000513325 DLG2Q15700 870 aa17.39■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 MAN2A1Q16706 1144 aa17.39■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
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HERC3-211ENST00000513325 SLC45A4Q5BKX6 768 aa17.39■□□□□ 0.37
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HERC3-211ENST00000513325 SH2D3CQ8N5H7 860 aa17.38■□□□□ 0.37
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HERC3-211ENST00000513325 MUC3BQ9H195 1237 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 KDM4CQ9H3R0 1056 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 WDCPQ9H6R7 721 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 ANLNQ9NQW6 1124 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 RAXQ9Y2V3 346 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 I6L893 689 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 ENC1O14682 589 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-211ENST00000513325 YKT6O15498 198 aa17.37■□□□□ 0.37
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