RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	TAF5	Q15542	800 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188		A6NNC1	897 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	SYN3	O14994	580 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ATG13	O75143	517 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	EPN2	O95208	641 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CHRNB1	P11230	501 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CYP4B1	P13584	511 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CYP2J2	P51589	502 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RPS6KA3	P51812	740 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	GALNT7	Q86SF2	657 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC25	Q86WR0	208 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TASP1	Q9H6P5	420 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188		Q9N2J8	555 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	THAP1	Q9NVV9	213 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	KL	Q9UEF7	1012 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	FEM1B	Q9UK73	627 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	DERA	Q9Y315	318 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM247	A6NEH6	219 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	MYMK	A6NI61	221 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188		B9A039	149 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188		H3BNX3	289 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CSF1	P09603	554 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RXRA	P19793	462 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TNFRSF1B	P20333	461 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RNF144B	Q7Z419	303 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RILPL2	Q969X0	211 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	SLC25A28	Q96A46	364 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RMI1	Q9H9A7	625 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	FZD3	Q9NPG1	666 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	RNF146	Q9NTX7	359 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		6.27	□□□□□ -1.4
RNF146-208	ENST00000495188		B4DGG1	531 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	PIP5K1C	O60331	668 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	FGF2	P09038	288 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	SCP2	P22307	547 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	KLRC2	P26717	231 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	TYK2	P29597	1187 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	SLC16A2	P36021	539 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	PLK5	Q496M5	336 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	C5orf22	Q49AR2	442 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	AWAT2	Q6E213	333 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	AAGAB	Q6PD74	315 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	TNNT1	P13805	278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	AVPR2	P30518	371 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM199	Q8N511	208 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	DPP10	Q8N608	796 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	LINS1	Q8NG48	757 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF146-208	ENST00000495188	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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