RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TRIM17Q9Y577 477 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.62□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SNX3O60493 162 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PAGE1O75459 146 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SUN1O94901 812 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CXCL10P02778 98 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MT-ND3P03897 115 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CSH1P0DML2 217 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CSH2P0DML3 217 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ALADP13716 330 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 KRT4P19013 534 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MGAT1P26572 445 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CCR1P32246 355 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SCTRP47872 440 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 NEK3P51956 506 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 COG7P83436 770 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SLC18A2Q05940 514 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ZNF33AQ06730 810 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 IFT88Q13099 833 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 USP4Q13107 963 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PDK4Q16654 411 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 DDR2Q16832 855 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CGB2Q6NT52 195 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 FUT10Q6P4F1 479 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 LRRC6Q86X45 466 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ARHGAP18Q8N392 663 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TTC9BQ8N6N2 239 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PPM1NQ8N819 430 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 APOPT1Q96IL0 206 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SERAC1Q96JX3 654 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TSGA13Q96PP4 275 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 VAT1Q99536 393 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 GPR62Q9BZJ7 368 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 GMIPQ9P107 970 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 GRID1Q9ULK0 1009 aa10.61□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 FAM92AA1XBS5 289 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 WDR27A2RRH5 827 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MTMR11A4FU01 709 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 KCNU1A8MYU2 1149 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TM9SF1O15321 606 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TBC1D4O60343 1298 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 VNN2O95498 520 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 AP2A1O95782 977 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PGAM1P18669 254 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CD68P34810 354 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CCNFP41002 786 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 FOXC1Q12948 553 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 HHATQ5VTY9 493 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 NUGGCQ68CJ6 796 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CYS1Q717R9 158 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PID1Q7Z2X4 250 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MON1AQ86VX9 555 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CEP57Q86XR8 500 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CCNJLQ8IV13 435 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SLC39A13Q96H72 371 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 B3GALT6Q96L58 329 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PGLYRP2Q96PD5 576 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SYBUQ9NX95 663 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 MOCS1Q9NZB8 636 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 DENND4CQ5VZ89 1909 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 UGT1A9O60656 530 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ALDH1A2O94788 518 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 NFKB1P19838 968 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.6□□□□□ -0.71
TNS1-217ENST00000490566 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms