RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489352.5

HDAC6-233, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-233	ENST00000489352	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352		A6NNZ2	444 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352		D6RAR5	112 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	TBL1X	O60907	577 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MOCS3	O95396	460 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CSF2	P04141	144 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ADORA2B	P29275	332 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CCKBR	P32239	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	DRD3	P35462	400 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CSK	P41240	450 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	IL17A	Q16552	155 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MYO19	Q96H55	970 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	PHACTR2	O75167	634 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ANXA6	P08133	673 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	LIF	P15018	202 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ZNF18	P17022	549 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	JUND	P17535	347 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CLDN2	P57739	230 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	PARG	Q86W56	976 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	NKD1	Q969G9	470 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	STIM2	Q9P246	746 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	KIF3A	Q9Y496	699 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352		A0A1W2PQU0	124 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	C9orf172	C9J069	976 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	JAK2	O60674	1132 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	GCNT3	O95395	438 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ATIC	P31939	592 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CCL7	P80098	99 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	KCNA1	Q09470	495 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MCM6	Q14566	821 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
HDAC6-233	ENST00000489352	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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