RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 UPP2O95045 317 aa20.9■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 COPAP53621 1224 aa20.9■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 KCTD11Q693B1 232 aa20.9■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 A6NHS1 94 aa20.89■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 CFAP157Q5JU67 520 aa20.89■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.89■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 EPAS1Q99814 870 aa20.89■□□□□ 0.94
IMP4-208ENST00000460766 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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IMP4-208ENST00000460766 SAT1P21673 171 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 CCL14Q16627 93 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
IMP4-208ENST00000460766 IL22Q9GZX6 179 aa20.87■□□□□ 0.93
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