RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 CALM1P0DP23 149 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CALM2P0DP24 149 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CALM3P0DP25 149 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 RBP3P10745 1247 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXB2P14652 356 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CD6P30203 668 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GRIK1P39086 918 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GNAQP50148 359 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ADCY7P51828 1080 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 IRF9Q00978 393 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF19Q2TAC6 998 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 FHL5Q5TD97 284 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 EMC10Q5UCC4 262 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CD300LGQ6UXG3 332 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 BEST2Q8NFU1 509 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 RDM1Q8NG50 284 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM143Q96AN5 459 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SGF29Q96ES7 293 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM227BQ96M60 508 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM20AQ96MK3 541 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ACAP3Q96P50 834 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PNKPQ96T60 521 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K14Q99558 947 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GULP1Q9UBP9 304 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.32□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 C22orf46C9J442 243 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 B4GALT5O43286 388 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 DYRK3O43781 588 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 USP12O75317 370 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 STBD1O95210 358 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP3A4P08684 503 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCB4P21439 1286 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFRSF4P43489 277 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC6A11P48066 632 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NAPAP54920 295 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 E2F1Q01094 437 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 IL9RQ01113 521 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 POU5F1BQ06416 359 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TRDNQ13061 729 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 RESTQ13127 1097 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR17Q13304 367 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NR0B2Q15466 257 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF77Q15935 545 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR16Q569H4 304 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPPQ6IPU0 288 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 ANO5Q75V66 913 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 MON1AQ86VX9 555 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TICAM2Q86XR7 235 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 SNX19Q92543 992 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 EVI5LQ96CN4 794 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP170P1Q96L14 293 aa4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ECHDC1-211ENST00000460558 RIT2Q99578 217 aa4.31□□□□□ -1.72
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