RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC11Q96DB2 347 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TMCO6Q96DC7 493 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF597Q96LX8 424 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NSMCE2Q96MF7 247 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 A8MU76 341 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KBTBD13C9JR72 458 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CHL1O00533 1208 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SSNA1O43805 119 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFS2O75306 463 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CLPXO76031 633 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL1O95922 423 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TGM2P21980 687 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TXKP42681 527 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AP1S2P56377 157 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OVGP1Q12889 678 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MPP2Q14168 576 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GPR68Q15743 365 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF6Q58WW2 860 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HYIQ5T013 277 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BICRALQ6AI39 1079 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZER1Q7Z7L7 766 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RTKN2Q8IZC4 609 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SGF29Q96ES7 293 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DYRK4Q9NR20 520 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LOC100653049A0A140TA62 436 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PIPSLA2A3N6 862 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 E9PI62 339 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KRT34O76011 436 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 WDPCPO95876 746 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA3P25788 255 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2C18P33260 490 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 DPYDQ12882 1025 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KCNN1Q92952 543 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 PRAM1Q96QH2 718 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF347Q96SE7 839 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GLTPQ9NZD2 209 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ASB4Q9Y574 426 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF98A6NK75 572 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TEX33O43247 280 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 IFNB1P01574 187 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 S100A8P05109 93 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 SLC26A3P40879 764 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 HNF4AP41235 474 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 GSTM5P46439 218 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TWF1Q12792 350 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 IL18R1Q13478 541 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MESDQ14696 234 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 TSNQ15631 228 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 FAM153CQ494X1 144 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF561Q8N587 486 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-209ENST00000442510 CKAP2Q8WWK9 683 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms