RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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ATG4B-210ENST00000428861 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
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ATG4B-210ENST00000428861 DNAJC7Q99615 494 aa11.01□□□□□ -0.65
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