RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 APBA2Q99767 749 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 AP5Z1O43299 807 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 FSBPO95073 299 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGB6P18564 788 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NDST1P52848 882 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PKNOX1P55347 436 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GMCL1Q96IK5 515 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TPD52L3Q96J77 140 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 JCADQ9P266 1359 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN7AQ01118 1682 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C0S8 307 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BMP10O95393 424 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 APOC2P02655 101 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NAGLUP54802 743 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PPATQ06203 517 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCL1Q15111 1095 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC23Q5W5X9 447 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF605Q86T29 641 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VAT1Q99536 393 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 REEP1Q9H902 201 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX3O60493 162 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS4BO75351 444 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 URODP06132 367 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GRK4P32298 578 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT3P49368 545 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DMPKQ09013 629 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIK3Q13003 919 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 Q4G0T1 1027 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CES3Q6UWW8 571 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 IKBIPQ70UQ0 350 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CREG2Q8IUH2 290 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB7Q9H672 318 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC18Q9H819 358 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 HACL1Q9UJ83 578 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH9Q9ULB4 789 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BRB1 525 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 VAV1P15498 845 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PAX7P23759 505 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3CGP48736 1102 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK10P53779 464 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 CSNK2BP67870 215 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR59Q6PJI9 974 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT74Q7RTS7 529 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 AMER2Q8N7J2 671 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM8Q9UJA3 840 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMG1O95456 288 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN19P0C672 248 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-10P10266 1014 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 LRPAP1P30533 357 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK3P51956 506 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ADIGQ0VDE8 80 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAP1Q15027 740 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL7BQ6UX53 244 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 PACS2Q86VP3 889 aa11.17□□□□□ -0.62
EFTUD2-202ENST00000426333 ADHFE1Q8IWW8 467 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms