RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBP1Q9NZI7 540 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRRDQ9UH36 339 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.11■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PQH9 124 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP9BO43861 1147 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSRP00390 522 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL2P10916 166 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1G1P47890 313 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPY2RP49146 381 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM189BP81408 668 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRPSAP1Q14558 356 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRTP1Q5TC63 336 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP2A3Q93084 1043 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D31Q96DN5 1066 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD3Q96ES6 412 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL22Q9GZX6 179 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLXNA3P51805 1871 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOXD2PA6NHM9 499 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACNG3O60359 315 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC6O75061 913 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNNO75324 88 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB3P29508 390 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRX4P78413 519 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DBN1Q16643 649 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C16orf46Q6P387 395 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTOP3Q7RTS5 596 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LZTR1Q8N653 840 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP33Q8TEY7 942 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBBP8Q99708 897 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSER1Q9NX31 292 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB4Q9UDY4 337 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCDC2Q9UHG0 476 aa19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEB16A2A368 324 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf71A6NGG8 1288 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AOC2O75106 756 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RASSF2P50749 326 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH17Q12864 832 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MUI8 341 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNU1A8MYU2 1149 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLIN3O60664 434 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAFKO60675 156 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAUS5O94927 633 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPH1P17752 444 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TYK2P29597 1187 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOGQ13253 232 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDHAF4Q5VUM1 108 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC91Q7Z6B0 441 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STRA8Q7Z7C7 330 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ISL2Q96A47 359 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB11Q96P15 392 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGAP2Q99490 1192 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC39A8Q9C0K1 460 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRAC1Q9NRG0 131 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDFIP2Q9NV92 336 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNK4Q9NYG8 393 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM28Q9UKQ2 775 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX13Q9UN79 622 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCML2Q9UQR0 700 aa19.09■□□□□ 0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VWA8A3KMH1 1905 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP3B1O00203 1094 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMD3O43242 534 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC8A1P32418 973 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEA12P43365 314 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIMK2P53671 638 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPM1JQ5JR12 505 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WLSQ5T9L3 541 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00523Q86TU6 105 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL12RB2Q99665 862 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX15Q9NRS6 342 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HS3ST4Q9Y661 456 aa19.08■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E9PAM4 449 aa19.07■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRP35270 261 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR15P49685 360 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms