RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PTPRD	P23468	1912 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF263	O14978	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	IRAK2	O43187	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TEX33	O43247	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TLR5	O60602	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MFAP3L	O75121	409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ATP2C2	O75185	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TBX10	O75333	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ECI2	O75521	394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ADCY5	O95622	1261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	NFATC1	O95644	943 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TSPAN15	O95858	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	LTF	P02788	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	INHBB	P09529	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	KRT3	P12035	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	NCAM1	P13591	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	RARG	P13631	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	LCP1	P13796	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PSMC3	P17980	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SDC4	P31431	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CASP14	P31944	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CCR1	P32246	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GPD2	P43304	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	IFNAR2	P48551	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF75D	P51815	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	KIF11	P52732	1056 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GPC5	P78333	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TNK2	Q07912	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TAF10	Q12962	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	BNIP3	Q12983	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PDCL	Q13371	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	UBR7	Q8N806	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM2-205	ENST00000420234	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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