RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARID5BQ14865 1188 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALFQ53S48 1182 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR45BQ5MNZ6 344 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMC6Q7Z403 805 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RABEPKQ7Z6M1 372 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM124AQ86V42 546 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYT12Q8IV01 421 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NTAN1Q96AB6 310 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBC1D31Q96DN5 1066 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC114Q96M63 670 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYT11Q9BT88 431 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPON2Q9BUD6 331 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR174Q9BXC1 333 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO1AQ9UBC5 1043 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ILVBLA1L0T0 632 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 I6L893 689 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BNIP3LO60238 219 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GYPCP04921 128 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNSP15586 552 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STK19P49842 368 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS14P62263 151 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL31Q6EBC2 164 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RETSATQ6NUM9 610 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF354CQ86Y25 554 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DRC7Q8IY82 874 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF683Q8IZ20 524 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC185Q8N715 623 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP76Q8TAP6 659 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NETO1Q8TDF5 533 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO19Q96H55 970 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EPAS1Q99814 870 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OMDQ99983 421 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCAPGQ9BPX3 1015 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEF6Q9H4E7 631 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MTG2Q9H4K7 406 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DONSONQ9NYP3 566 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HPCAL4Q9UM19 191 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DOCK4Q8N1I0 1966 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CBX4O00257 560 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CREB3O43889 395 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADH1BP00325 375 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL1BP01584 269 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFIP05156 583 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RHOQP17081 205 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ITPKAP23677 461 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 L1CAMP32004 1257 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HOXD12P35452 270 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAPKAPK2P49137 400 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCAPQ12770 1279 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DLG2Q15700 870 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DUOXA1Q1HG43 343 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB6CQ53S08 254 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM61Q5EBN2 209 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9orf64Q5T6V5 341 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM46CQ5VWP2 391 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 STK40Q8N2I9 435 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CADM4Q8NFZ8 388 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8K1Q8NGG5 319 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR8D1Q8WZ84 308 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALG14Q96F25 216 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAB6CQ9H0N0 254 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ISCUQ9H1K1 167 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SGK2Q9HBY8 427 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP13A1Q9HD20 1204 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD93Q9NPY3 652 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXL12Q9NXK8 326 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms