RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 BBS2Q9BXC9 721 aa14.6□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 HPS4Q9NQG7 708 aa14.6□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 AMACRQ9UHK6 382 aa14.6□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.6□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 FAM187AA6NFU0 413 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 ARNTLO00327 626 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 CACNG3O60359 315 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 MAP3K6O95382 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 RHOCP08134 193 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 ADH5P11766 374 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 TYRP14679 529 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 ARSAP15289 507 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 DR1Q01658 176 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 CDH18Q13634 790 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 FSCBQ5H9T9 825 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 MFN1Q8IWA4 741 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 ECT2Q9H8V3 914 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF3B1-204ENST00000414963 A0A0D9SEW6 157 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 C5orf60A6NFR6 353 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 DFFAO00273 331 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 MATN3O15232 486 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 KDELR3O43731 214 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ECEL1O95672 775 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 GAS8O95995 478 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 RBL1P28749 1068 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ACVRL1P37023 503 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 IL10RBQ08334 325 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 NR1H3Q13133 447 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 RUNX3Q13761 415 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 GRM2Q14416 872 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 GAB4Q2WGN9 574 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ANO4Q32M45 955 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 CPA6Q8N4T0 437 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 NETO2Q8NC67 525 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 CCNYQ8ND76 341 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 MAML1Q92585 1016 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ZNF599Q96NL3 588 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 EBF3Q9H4W6 596 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 PLK2Q9NYY3 685 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 RAD51CO43502 376 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 PRAMEF11O60813 436 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 GCATO75600 419 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ZMPSTE24O75844 475 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 PEX11BO96011 259 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 CISD3P0C7P0 127 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 VAV1P15498 845 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 GDI1P31150 447 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 TNK2Q07912 1038 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 AP1B1Q10567 949 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 LMAN2Q12907 356 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 DMC1Q14565 340 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 C8orf74Q6P047 294 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 JAMLQ86YT9 394 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 OR7D4Q8NG98 312 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 BHMTQ93088 406 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 VAT1Q99536 393 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 KCNK12Q9HB15 430 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 PDFQ9HBH1 243 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B1-204ENST00000414963 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms