RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 ILVBLA1L0T0 632 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNAP91O60641 907 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 SIN3BO75182 1162 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RHOBTB1O94844 696 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPN2O95208 641 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RHOQP17081 205 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 DESP17661 470 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF75DP51815 510 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNGA4Q8IV77 575 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 FRS2Q8WU20 508 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRCH4O75427 683 aa22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 MIPP30301 263 aa22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR7D4Q8NG98 312 aa22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPRN2Q92932 1015 aa22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS51Q9UID3 782 aa22.59■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP9BO43861 1147 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNF8O76064 485 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGLV3-19P01714 112 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 NNMTP40261 264 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAPKAPK2P49137 400 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 TPMTP51580 245 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPS14P62263 151 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNA12Q03113 381 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 CA9Q16790 459 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACUL1Q86Y37 369 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 TC2NQ8N9U0 490 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 NUP85Q9BW27 656 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.58■■□□□ 1.21
IGHV3-20-201ENST00000390606 THADAQ6YHU6 1953 aa22.58■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP3K13O43283 966 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRP3O75074 770 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZMPSTE24O75844 475 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 MT-CO1P00395 513 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 VAV1P15498 845 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLDCP23378 1020 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCK1P35558 622 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT83P78385 493 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPEM2Q0P670 501 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACAP1Q15027 740 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM129BQ96TA1 746 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPAS1Q99814 870 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEF6Q9H4E7 631 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 CREB3O43889 395 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 AKR1B10O60218 316 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPHB2P29323 1055 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB16Q05516 673 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 BTBD6Q96KE9 485 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAI1Q9UI46 699 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP18Q9UMW8 372 aa22.56■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 WASH4PA8MWX3 477 aa22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRPSAP2O60256 369 aa22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 SRCP12931 536 aa22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCF4P15884 667 aa22.55■■□□□ 1.2
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