RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 FAM72BQ86X60 149 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RNF148Q8N7C7 305 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RNF169Q8NCN4 708 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 URGCPQ8TCY9 931 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MARK4Q96L34 752 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 BTBD9Q96Q07 612 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 IGSF9Q9P2J2 1179 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 STK39Q9UEW8 545 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ADAM28Q9UKQ2 775 aa19.19■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 OTOFQ9HC10 1997 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SPTLC1O15269 473 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TRIM13O60858 407 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PTPN3P26045 913 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PMLP29590 882 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SPRP35270 261 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SLC5A9Q2M3M2 681 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 DCAF6Q58WW2 860 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SPATA24Q86W54 205 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 DSELQ8IZU8 1212 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 LILRA2Q8N149 483 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 NMRAL1Q9HBL8 299 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ANLNQ9NQW6 1124 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 VANGL2Q9ULK5 521 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 CCDC78A2IDD5 438 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TMEM114B3SHH9 223 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MATN2O00339 956 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 IRF6O14896 467 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 AP1G1O43747 822 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MS4A2Q01362 244 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ADIGQ0VDE8 80 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 DPYSQ14117 519 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PDK1Q15118 436 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 KYAT1Q16773 422 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ZNF423Q2M1K9 1284 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SLC25A52Q3SY17 297 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TMEM135Q86UB9 458 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 NT5DC4Q86YG4 428 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 METTL25Q8N6Q8 603 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RCN3Q96D15 328 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SNX27Q96L92 541 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 CDRT15Q96T59 188 aa19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 I6L893 689 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SNX16P57768 344 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 CEACAM7Q14002 265 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB6Q15916 424 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 UNC93AQ86WB7 457 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MARVELD2Q8N4S9 558 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MCMBPQ9BTE3 642 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 NUF2Q9BZD4 464 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 LRRC40Q9H9A6 602 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 VCX3AQ9NNX9 186 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 OXSMQ9NWU1 459 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RBPJLQ9UBG7 517 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RIMS3Q9UJD0 308 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 GINS2Q9Y248 185 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SBF1O95248 1867 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 DCLK1O15075 740 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 GRID2O43424 1007 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ATP9BO43861 1147 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 CRTAMO95727 393 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SCNN1AP37088 669 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 NDUFV1P49821 464 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RABGGTBP53611 331 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 NME3Q13232 169 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ARMC3Q5W041 872 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 C9orf57Q5W0N0 161 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 SLC7A14Q8TBB6 771 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 RNF217Q8TC41 542 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 CHRAC1Q9NRG0 131 aa19.17■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 DENRO43583 198 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 BEST1O76090 585 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TFAP2AP05549 437 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TPH1P17752 444 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 TTLL4Q14679 1199 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PIGGQ5H8A4 983 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 METTL21CQ5VZV1 264 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 HFE2Q6ZVN8 426 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PIGZQ86VD9 579 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 CATSPER2Q96P56 530 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 FERMT1Q9BQL6 677 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 ZNF385DQ9H6B1 395 aa19.16■□□□□ 0.66
CITED2-201ENST00000367651 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms