RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361350.5

SSBP3-AS1-201, SSBP3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene SSBP3-AS1, Length 2,624 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SLC5A2P31639 672 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ARRB2P32121 409 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SCNN1AP37088 669 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CCR3P51677 355 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CHN2P52757 468 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 EPHB1P54762 984 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ASPHQ12797 758 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TUBB3Q13509 450 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 OLIG2Q13516 323 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 MYLK3Q32MK0 819 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CES3Q6UWW8 571 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 MAVSQ7Z434 540 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TTC30AQ86WT1 665 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 NUP93Q8N1F7 819 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 GSDMBQ8TAX9 411 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RTP4Q96DX8 246 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ZNF560Q96MR9 790 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PNPOQ9NVS9 261 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ARHGAP42A6NI28 874 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SDR42E2A6NKP2 422 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 DPYSL4O14531 572 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TPP1O14773 563 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PPEF2O14830 753 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CPOXP36551 454 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 MAGEA3P43357 314 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SNX17Q15036 470 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PPM1JQ5JR12 505 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SLC9A4Q6AI14 798 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ZNF280DQ6N043 979 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 Q6ZNX1 250 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ARPINQ7Z6K5 226 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ACOT1Q86TX2 421 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TRPV5Q9NQA5 729 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ZNF358Q9NW07 568 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SNTG2Q9NY99 539 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 FLRT1Q9NZU1 646 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 NME7Q9Y5B8 376 aa10□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SERPINB7O75635 380 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CD1EP15812 388 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TGM2P21980 687 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PEX2P28328 305 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CRHR1P34998 444 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PKDCCQ504Y2 493 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 LGSNQ5TDP6 509 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 MBLAC2Q68D91 279 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 C14orf80Q86SX3 495 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 OSMRQ99650 979 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ACSS2Q9NR19 701 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 E9PBE3 544 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 AP1G1O43747 822 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SERPINA6P08185 405 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SDC4P31431 198 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 HALP42357 657 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ABCG1P45844 678 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.99□□□□□ -0.81
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PAOXQ6QHF9 649 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms