RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANO10Q9NW15 660 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 RRN3Q9NYV6 651 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MPP6Q9NZW5 540 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP24Q9UPU5 2620 aa23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 LGALS16A8MUM7 142 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNT1Q5JUK3 1230 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA0895LQ68EN5 471 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCEH1Q6PIU2 408 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 GAREM1Q9H706 876 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 VPS28Q9UK41 221 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHD5Q8TDI0 1954 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNAP91O60641 907 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLDN11O75508 207 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF18P17022 549 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH4P55283 916 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIF19Q2TAC6 998 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 HLA-BQ31612 363 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM131BQ86XD5 332 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SARDHQ9UL12 918 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCML1Q9UN30 329 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX11Q9Y5W9 270 aa23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPEGQ15772 3267 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 C10orf142B7Z368 130 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNK3O14649 394 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MT-CO1P00395 513 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL1BP01584 269 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP1A3P13637 1013 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MMP8P22894 467 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD27P26842 260 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 DRD3P35462 400 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP11AP98196 1134 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SULT2A1Q06520 285 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 Q6ZVU0 165 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF677Q86XU0 584 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 NAXDQ8IW45 347 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC6A18Q96N87 628 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPAG5Q96R06 1193 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 OMDQ99983 421 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MUC3BQ9H195 1237 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A0D9SEW6 157 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 DRGXA6NNA5 263 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 E9PAM4 449 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 K7ERQ8 282 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 WNT9AO14904 365 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP9BO43861 1147 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 F9P00740 461 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPM2P07951 284 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 RHOCP08134 193 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 GLDCP23378 1020 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 NNMTP40261 264 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADPRHP54922 357 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 OXCT1P55809 520 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTP4A2Q12974 167 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MTA1Q13330 715 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 DLG2Q15700 870 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 POM121L1PQ3SYA9 428 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACCSLQ4AC99 568 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SH2D3CQ8N5H7 860 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCNM1Q9BWG6 230 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC25A13Q9UJS0 675 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 FZD4Q9ULV1 537 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACNA1BQ00975 2339 aa23.34■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPRBP23467 1997 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADH1BP00325 375 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 C5AR1P21730 350 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 STAT1P42224 750 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP2CBP62714 309 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP2CAP67775 309 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 UBXN1Q04323 297 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 TYRO3Q06418 890 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC14A1Q13336 389 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDO1Q16878 200 aa23.33■■□□□ 1.33
TNFRSF25-201ENST00000348333 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms