RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGAVP06756 1048 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MED8Q96G25 268 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO1BQ9BR76 489 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 LHX5Q9H2C1 402 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF839A8K0R7 811 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IL2P60568 153 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RCN1Q15293 331 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 REPS1Q96D71 796 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP42Q96MM3 310 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MTA2O94776 668 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ACADSP16219 412 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF23P17027 643 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RRM2P31350 389 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPZA2P47755 286 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ALLCQ8N6M5 410 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MPP6Q9NZW5 540 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PADI4Q9UM07 663 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS4BO75351 444 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 USP1O94782 785 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DGKAP23743 735 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN4P29074 926 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 GRK4P32298 578 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 KYQ8NBH2 561 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.258e-9■■■■□ 22.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ALADP13716 330 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ERCC2P18074 760 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2R1BP30154 601 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 HIPK3Q9H422 1215 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SNTNA6NMZ2 147 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BQF6 201 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TLR5O60602 858 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-CO1P00395 513 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RFX3P48380 749 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS33AQ96AX1 596 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CCT7Q99832 543 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NOD2Q9HC29 1040 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 STK39Q9UEW8 545 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NFKB1P19838 968 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FMO4P31512 558 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CD86P42081 329 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf29Q8N999 325 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TTPALQ9BTX7 342 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO10Q9UK96 956 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BMP10O95393 424 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FCGR1AP12314 374 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 HPGDP15428 266 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TYMPP19971 482 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 SCTRP47872 440 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NPNTQ6UXI9 565 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 ADCK1Q86TW2 530 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND1CQ8IV53 801 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 MAN1A2O60476 641 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A5P33763 92 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 BRCC3P46736 316 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 CRY1Q16526 586 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-201ENST00000344528 VSTM1Q6UX27 236 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms