RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TPP1O14773 563 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ATP12AP54707 1039 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF544Q6NX49 715 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PANX3Q96QZ0 392 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK18Q7Z418 384 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RGS14O43566 566 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF862O60290 1169 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA4P29622 427 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SIX5Q8N196 739 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PIPSLA2A3N6 862 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 MRASO14807 208 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PDE5AO76074 875 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PFKPQ01813 784 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 CHST7Q9NS84 486 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 RAD23AP54725 363 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC35C1Q96A29 364 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 COL26A1Q96A83 441 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ADI1Q9BV57 179 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SERHL2Q9H4I8 314 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SERHLQ9NQF3 203 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087X1B8 175 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 THAP1Q9NVV9 213 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ELMO1Q92556 727 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BQF6 201 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ATP9AO75110 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ABL2P42684 1182 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC18Q9H819 358 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 APBB2Q92870 758 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 FCHO1O14526 889 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAG1P54619 331 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 NDUFS2O75306 463 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 VAV1P15498 845 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KDELR1P24390 212 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TALDO1P37837 337 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 THOP1P52888 689 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 CYP2A13Q16696 494 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PORCNQ9H237 461 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.72■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.72■■□□□ 1.23
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PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM30Q9UKF2 790 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 NWD1Q149M9 1564 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM24O15164 1050 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 RAB14P61106 215 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KAT5Q92993 513 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-201ENST00000332175 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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