RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ACOX2Q99424 681 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 NDFIP2Q9NV92 336 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO4Q9UKT5 387 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ERVW-1Q9UQF0 538 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 STON1Q9Y6Q2 735 aa27.44■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SGK1O00141 431 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 RAMP2O60895 175 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ERCC2P18074 760 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ARSEP51690 589 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 DGKEP52429 567 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC173Q0VFZ6 552 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 DPYSQ14117 519 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CRY1Q16526 586 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 GABRG3Q99928 467 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 KCNH6Q9H252 994 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0D9SEW6 157 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 MACROD2A1Z1Q3 448 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 PSTPIP1O43586 416 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM23O75077 832 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 KDELR1P24390 212 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 VASPP50552 380 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SATB1Q01826 763 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRNQ16849 979 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ODF2Q5BJF6 829 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SYCE1Q8N0S2 351 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CAMKK1Q8N5S9 505 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 LZTR1Q8N653 840 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF4L2Q8NA75 395 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 TSC1Q92574 1164 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CSPG4P5Q96PW8 444 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SPON2Q9BUD6 331 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SUN2Q9UH99 717 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SLC25A13Q9UJS0 675 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 HPCAL4Q9UM19 191 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 HYOU1Q9Y4L1 999 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CKAP5Q14008 2032 aa27.42■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 IL12RB1P42701 662 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 NDST2P52849 883 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 IL31Q6EBC2 164 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 VSIG1Q86XK7 387 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 OR7D4Q8NG98 312 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 PSMB7Q99436 277 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF670Q9BS34 389 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CALN1Q9BXU9 219 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM245Q9H330 911 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ATP13A1Q9HD20 1204 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM10Q9UDY6 481 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0U1RQJ8 604 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 WASH3PC4AMC7 463 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 TNNT1P13805 278 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 HOXB2P14652 356 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 AMPD1P23109 780 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 IL4RP24394 825 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA6P31267 233 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 WASP42768 502 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 SLC20A2Q08357 652 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 DPYSL3Q14195 570 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ANGPT1Q15389 498 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 PARP15Q460N3 678 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ATRIPQ8WXE1 791 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 GOLPH3Q9H4A6 298 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf42Q9NWW7 574 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 GUCA1BQ9UMX6 200 aa27.41■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CBX4O00257 560 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 NRLP54845 237 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 STARD3Q14849 445 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF528Q3MIS6 628 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 RETSATQ6NUM9 610 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 TMCO3Q6UWJ1 677 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC57Q8N9N7 239 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 RAPGEF5Q92565 580 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 VPS51Q9UID3 782 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa27.4■■□□□ 1.98
CRIP1-201ENST00000330233 LRRD1A4D1F6 860 aa27.39■■□□□ 1.97
CRIP1-201ENST00000330233 GRID2IPA4D2P6 1211 aa27.39■■□□□ 1.97
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF487B1APH4 448 aa27.39■■□□□ 1.97
CRIP1-201ENST00000330233 RASA4BC9J798 803 aa27.39■■□□□ 1.97
CRIP1-201ENST00000330233 DCLK1O15075 740 aa27.39■■□□□ 1.97
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms