RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 TTC17Q96AE7 1141 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ALG14Q96F25 216 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ACOX2Q99424 681 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 AMFRQ9UKV5 643 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN12O43309 604 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ATG13O75143 517 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 FTCDO95954 541 aa22.9■■□□□ 1.26
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HOXD4-201ENST00000306324 IL4RP24394 825 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 WASP42768 502 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 MARCKSL1P49006 195 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 IL31Q6EBC2 164 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 KRT35Q92764 455 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF670Q9BS34 389 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD4-201ENST00000306324 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ASLP04424 464 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 ETFBP38117 255 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ECT2LQ008S8 904 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF234Q14588 700 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 E2F5Q15329 346 aa22.89■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SDE2Q6IQ49 451 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ACDQ96AP0 544 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 IER2Q9BTL4 223 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEH1Q9H213 219 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 WASH3PC4AMC7 463 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CBX4O00257 560 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 DCLK1O15075 740 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NTSR1P30989 418 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.88■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 PSMB7Q99436 277 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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HOXD4-201ENST00000306324 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CKAP5Q14008 2032 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SGK1O00141 431 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NPC1O15118 1278 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SNAP91O60641 907 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 GLDCP23378 1020 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 IL12RB1P42701 662 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ST8SIA6P61647 398 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 EOGTQ5NDL2 527 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NPWQ8N729 165 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NETO2Q8NC67 525 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 VPS51Q9UID3 782 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC66A2RUB6 948 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RASA4BC9J798 803 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 RASA4O43374 803 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM23O75077 832 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 CTNNA2P26232 953 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 NDST2P52849 883 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD4-201ENST00000306324 PARP15Q460N3 678 aa22.86■■□□□ 1.25
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