RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.19■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PR77 199 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PLK4O00444 970 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DAB1O75553 588 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 GGCXP38435 758 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 METAP1P53582 386 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SNX16P57768 344 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2CBP62714 309 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2CAP67775 309 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SLC6A3Q01959 620 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MTA1Q13330 715 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SYNCQ9H7C4 482 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 GDF3Q9NR23 364 aa20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 M0QYT0 321 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ATP9BO43861 1147 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 RTN2O75298 545 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PAGE1O75459 146 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 NOS2P35228 1153 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 CLCN1P35523 988 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 UBE2HP62256 183 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SHBQ15464 509 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 C14orf80Q86SX3 495 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MLKLQ8NB16 471 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SIK2Q9H0K1 926 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 VPS28Q9UK41 221 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SARDHQ9UL12 918 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.17■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FAM149AA5PLN7 773 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 LATO43561 262 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 CLDN11O75508 207 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ITGAVP06756 1048 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DLG2Q15700 870 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 DHRS13Q6UX07 377 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 Q6ZVU0 165 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SAP25Q8TEE9 199 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TLR4O00206 839 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 YKT6O15498 198 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SLC7A4O43246 635 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF18P17022 549 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 CDH4P55283 916 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 NXPH1P58417 271 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 CNTN1Q12860 1018 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MAN2A1Q16706 1144 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 C5orf22Q49AR2 442 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 NPY6RQ99463 290 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 MUC3BQ9H195 1237 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PIGVQ9NUD9 493 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.15■□□□□ 0.82
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS20P59510 1910 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 CBX4O00257 560 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ENC1O14682 589 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 MCF2LO15068 1137 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ALOX15BO15296 676 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 BNIP3LO60238 219 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 ADCY5O95622 1261 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL3-201ENST00000296026 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms