RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MMP13P45452 471 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RFX3P48380 749 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 EPS8Q12929 822 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf46Q6P387 395 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA4DQ92854 862 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DYRK3O43781 588 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ADRB2P07550 413 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-10P10266 1014 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3R1P27986 724 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PHKG1Q16816 387 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DPP10Q8N608 796 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 HS6ST1O60243 411 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 USP12O75317 370 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LBPP18428 481 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BBS12Q6ZW61 710 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BCL9O00512 1426 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RCCD1A6NED2 376 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BNIPLQ7Z465 357 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 REPS1Q96D71 796 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LRPAP1P30533 357 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TTKP33981 857 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD10Q14728 455 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 INAQ16352 499 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CASP12Q6UXS9 341 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CDK20Q8IZL9 346 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf60Q96EN9 201 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 HGH1Q9BTY7 390 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQJ8 604 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 WNT10BO00744 389 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC130P13994 396 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NUMBP49757 651 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF544Q6NX49 715 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.48■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 FSCN2O14926 492 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 S100A3P33764 101 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PLK1P53350 603 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 FMO1Q01740 532 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NEDD8Q15843 81 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CERKQ8TCT0 537 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CERS2Q96G23 380 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RNF157Q96PX1 679 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MRIQ9BWK5 157 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD7Q9P203 1132 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MEIS2O14770 477 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB6P18564 788 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NAA20P61599 178 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RNFT2Q96EX2 444 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 IPPQ9Y573 584 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PRR23AA6NEV1 266 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CNTN2Q02246 1040 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 GPSM1Q86YR5 675 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NAGLUP54802 743 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 IL2P60568 153 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OPTCQ9UBM4 332 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC2Q9UJX6 822 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 H3BMM5 538 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TK2O00142 265 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF6O95976 241 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB4P28070 264 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LGI2Q8N0V4 545 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PYDC1Q8WXC3 89 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms