RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SHISA7A6NL88 538 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RAMP2O60895 175 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 NFATC1O95644 943 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ADH1CP00326 375 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RHOCP08134 193 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RHOQP17081 205 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 WASP42768 502 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 C2orf54Q08AI8 447 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 AP1B1Q10567 949 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SLC9A4Q6AI14 798 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 GJD3Q8N144 294 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 P3H4Q92791 437 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 AZIN2Q96A70 460 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ACOX2Q99424 681 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 OBP2AQ9NY56 170 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SOBPA7XYQ1 873 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RASA4BC9J798 803 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RASA4O43374 803 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ETS1P14921 441 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TCF3P15923 654 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CTHP32929 405 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 DGKGP49619 791 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CDH4P55283 916 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 GNA12Q03113 381 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TAZQ16635 292 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FAM50BQ9Y247 325 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 KRBA1A5PL33 1030 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D3BA6NDS4 549 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 KRIT1O00522 736 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CACNG3O60359 315 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CLDN11O75508 207 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 GALK1P51570 392 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 MAXP61244 160 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 GAD2Q05329 585 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 C2orf27AQ580R0 203 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TTC27Q6P3X3 843 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 BBS12Q6ZW61 710 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PRELID2Q8N945 189 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FOXQ1Q9C009 403 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 LRRC19Q9H756 370 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 GGA2Q9UJY4 613 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TJP3O95049 919 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 LATS1O95835 1130 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 HLA-EP13747 358 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 VPS41P49754 854 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ARF5P84085 180 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 MTM1Q13496 603 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PDGFRLQ15198 375 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 C5orf22Q49AR2 442 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SIX5Q8N196 739 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CPA6Q8N4T0 437 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 DEC1Q9P2X7 70 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 VPS51Q9UID3 782 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 HCN2Q9UL51 889 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 APOC2P02655 101 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 CISD3P0C7P0 127 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 RBP3P10745 1247 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPA-201ENST00000260116 SRFP11831 508 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms