RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 VPS28Q9UK41 221 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 INVSQ9Y283 1065 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.86■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PRR23AA6NEV1 266 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CREB3O43889 395 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ZMPSTE24O75844 475 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MT-CO1P00395 513 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 GLDCP23378 1020 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 EPHB2P29323 1055 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 STARD3Q14849 445 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TCEAL1Q15170 157 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 FRS2Q8WU20 508 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RLN3Q8WXF3 142 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PTPRN2Q92932 1015 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MUC3BQ9H195 1237 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CD93Q9NPY3 652 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 DNAI1Q9UI46 699 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 VPS51Q9UID3 782 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 INTUQ9ULD6 942 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MTA2O94776 668 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ACVRL1P37023 503 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 P2RY2P41231 377 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MAPKAPK2P49137 400 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 GNA12Q03113 381 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SPC24Q8NBT2 197 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 EPAS1Q99814 870 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SUN2Q9UH99 717 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 NUP205Q92621 2012 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PIEZO1Q92508 2521 aa22.84■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ATP9BO43861 1147 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 PROSCO94903 275 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 CD160O95971 181 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RARAP10276 462 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA1P43355 309 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ST8SIA6P61647 398 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 BOLA3Q53S33 107 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 OR2T3Q8NH03 318 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 KLC2Q9H0B6 622 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 TFR2Q9UP52 801 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.83■■□□□ 1.25
SYF2-201ENST00000236273 SIN3BO75182 1162 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 VAV1P15498 845 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 BCKDHBP21953 392 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 HTR7P34969 479 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 DPYSL2Q16555 572 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD6Q86V97 674 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PGBD3Q8N328 593 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 FAM129BQ96TA1 746 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 ZWILCHQ9H900 591 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 K7ERQ8 282 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 SRCP12931 536 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 GOT1P17174 413 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 HCAR3P49019 387 aa22.82■■□□□ 1.24
SYF2-201ENST00000236273 MRE11P49959 708 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms