RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stap2Q8R0L1 411 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slco3a1Q8R3L5 710 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Spns2Q91VM4 549 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem168Q91VX9 697 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CenpqQ9CPQ5 267 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc94Q9D6J3 314 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ParvaQ9EPC1 372 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ParvbQ9ES46 365 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chrna6Q9R0W9 494 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 R3hdmlA2A5I3 253 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cisd3B1AR13 137 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scgb2b19J3QM75 112 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm3542K7N6U2 270 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Akap1O08715 857 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GmnnO88513 206 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MpoP11247 718 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ZfaP23607 742 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DctP29812 517 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SiaeP70665 541 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5935Q497S0 212 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HiraQ61666 1015 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Il17cQ8K4C5 194 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpina3nQ91WP6 418 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pomgnt1Q91X88 660 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SncaipQ99ME3 962 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EefsecQ9JHW4 583 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm16430A6X8J1 155 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 E230025N22RikG5E8S3 482 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ltb4rO88855 351 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gna12P27600 379 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rasgrf1P27671 1262 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Marcksl1P28667 200 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wee1P47810 646 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mapkapk2P49138 386 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pde1aQ61481 565 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf728Q6P5C7 752 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fnbp1Q80TY0 616 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sept10Q8C650 452 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpp25Q91WE3 199 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 March2Q99M02 246 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Efhc2Q9D485 750 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Actn2Q9JI91 894 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HephQ9Z0Z4 1157 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Alms1Q8K4E0 3251 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcng1A2BDX4 514 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm3488M0QW81 238 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CraddO88843 199 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Schip1P0DPB4 484 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AvpP35455 168 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Itga4Q00651 1039 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam47cQ14BE7 430 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnfaip2Q61333 691 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sin3bQ62141 1098 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc117Q6PB51 277 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm6377Q8BHV4 303 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Enpp4Q8BTJ4 456 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam161aQ8QZV6 448 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr6Q99ME2 1125 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cfap57Q9D180 1249 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Thap11Q9JJD0 305 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mta2Q9R190 668 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp985A2A7A5 519 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm14781A2A9Q9 366 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr742A2RTP5 311 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AU015836B2RUM3 263 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HdcP23738 662 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc11a1P41251 548 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 St14P56677 855 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mageb5Q14AN0 366 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr59Q8C0M0 992 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Btbd6Q8K2J9 488 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mlc1Q8VHK5 382 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd7Q9D504 279 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Jph3Q9ET77 744 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prl2a1Q9JHK0 228 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apobec2Q9WV35 224 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cfap54Q8C6S9 3106 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tcf20Q9EPQ8 1987 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zbtb34A2ATY4 518 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp952B0V2W4 504 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DgkiD3YWQ0 1071 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cuzd1P70412 606 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd80Q00609 306 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ddr1Q03146 911 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Osgin2Q3TEE9 550 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prickle1Q3U5C7 832 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.5 ms