RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Yipf2Q99LP8 312 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lilrb4Q64281 335 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CK137956B1AYM9 596 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gjb1P28230 283 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8BH50 245 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map3k14Q9WUL6 942 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tas2r109Q7M707 316 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LnpkQ7TQ95 425 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Thap3Q8BJ25 218 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ItchQ8C863 864 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PodxlQ9R0M4 503 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ssxb9A2BI93 185 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Axin1O35625 863 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chst3O88199 472 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Msh3P13705 1091 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mmp3P28862 477 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ParpbpQ6IRT3 573 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam126bQ8C729 530 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Klhl2Q8JZP3 593 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cops7aQ9CZ04 275 aa17.78■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm13088A2AGW6 460 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2-M9O19442 342 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Caap1Q8VDY9 356 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kdm4bQ91VY5 1086 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CygbQ9CX80 190 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc166S4R181 449 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arl14Q3SXC5 192 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc29Q80VM3 471 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clip4Q8CI96 704 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EqtnQ9D9V2 337 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2abC0HKE1 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2acC0HKE2 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2adC0HKE3 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2aeC0HKE4 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2agC0HKE5 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2anC0HKE7 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2apC0HKE9 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zfp780bE9Q2S6 806 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Inpp5aE9QAS7 422 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nek2O35942 443 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pstpip1P97814 415 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vat1Q62465 406 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8CCC3 530 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2afjQ8R1M2 129 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hdhd5Q91WM2 419 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam136aQ9CR98 138 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tmem86aQ9D8N3 241 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm17615E9Q9P2 165 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Klc4Q9DBS5 619 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bcl10Q9Z0H7 233 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa17.77■□□□□ 0.44
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MaffO54791 156 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 C1orf109Q499E6 217 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fgl1Q71KU9 314 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc15a5Q8CBB2 566 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PudpQ9D5U5 234 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Calr3Q9D9Q6 380 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sertad3Q9ERC3 197 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Iqca1lA6H690 825 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ptrhd1D3Z4S3 140 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr611K7N609 323 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr612L7N462 323 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttc39dQ0VF76 604 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adcy2Q80TL1 1090 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr1Q8K087 353 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fig4Q91WF7 907 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 B4galt5Q9JMK0 388 aa17.77■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf19bA2A7Q9 732 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r38G3UYA8 861 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r33K7N705 861 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r44L7N2E1 861 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc27a2O35488 620 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncam1P13595 1115 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam46cQ5SSF7 391 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fnip1Q68FD7 1165 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbxo21Q8VDH1 627 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Grik3B1AS29 919 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TpteG5E8H5 664 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc30a1Q60738 503 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Prrg3Q6PAQ9 231 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fkbp6Q91XW8 327 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tex46Q9CPU3 165 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EXOC1LB9EK06 172 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nrsn1P97799 196 aa17.76■□□□□ 0.43
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms