RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rprd1aQ8VDS4 312 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fgd4Q91ZT5 766 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tas1r2Q925I4 843 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CenpsQ9D084 142 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eef1akmt2Q9D853 244 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Extl1Q9JKV7 669 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TfebQ9R210 475 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klf6O08584 283 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccna2P51943 422 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdh6P97326 790 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Psmb4P99026 264 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Psg28Q4KL66 472 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cfhr2Q4LDF6 332 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc5a10Q5SWY8 596 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp3a13Q64464 503 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ubap1Q8BH48 502 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TraipQ8VIG6 470 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q922R1 422 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kif12Q9D2Z8 642 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Jph2Q9ET78 696 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Acox2Q9QXD1 681 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2b13A6H6J2 491 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4930558K02RikE0CXC6 182 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pik3r2O08908 722 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Syce2Q505B8 171 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc8bQ5DU41 803 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ddx4Q61496 702 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Xlr3cQ61806 226 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Casc4Q6P2L7 435 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Palm2Q8BR92 376 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sept8Q8CHH9 429 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zbtb44Q8R0A2 453 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rin1Q921Q7 763 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ecrg4Q99LS0 148 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa8.64□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gsta3P30115 221 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cog7Q3UM29 770 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm29609Q3UU56 907 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Glp2rQ5IXF8 512 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trpm4Q7TN37 1213 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr412Q7TRW7 312 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gtf3c2Q8BL74 907 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc18a2Q8BRU6 517 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Amz1Q8BVF9 502 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr11Q8K1X1 1223 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc22a19Q8VCA0 551 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhb19Q91Y01 801 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Robo3Q9Z2I4 1366 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Akap17bA2A3V1 959 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tbkbp1A2A9T0 611 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adamts6D3Z1A5 1117 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm10720D3Z1I5 223 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccdc153P0C7Q1 202 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PolP11369 1281 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd247P24161 164 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdcd1Q02242 288 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1046Q7TR79 316 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr299Q7TS05 330 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Got1l1Q7TSV6 404 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q8BHN7 327 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trpa1Q8BLA8 1125 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vwa1Q8R2Z5 415 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmed5Q9CXE7 229 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 LrgukQ9D5S7 820 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mical3Q8CJ19 1993 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2j12G3UXT0 502 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ncam2O35136 837 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ap3d1O54774 1199 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PuraP42669 321 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vps45P97390 570 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cntn3Q07409 1028 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ProcrQ64695 242 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sp140Q6NSQ5 534 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Chst10Q6PGK7 356 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gprc5aQ8BHL4 356 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Robo4Q8C310 1012 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trip10Q8CJ53 603 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Setd7Q8VHL1 366 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pard3bQ9CSB4 1203 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Duoxa2Q9D311 320 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slfn2Q9Z0I6 378 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r70K7N702 854 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sept4P28661 478 aa8.63□□□□□ -1.03
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q3KNL4 93 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms