RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc4bP0C192 709 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PfkmP47857 780 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slfn4Q3UV66 602 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mef2dQ63943 514 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AW551984Q8BGF0 804 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr180Q8BPS4 441 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smim11aQ99J19 55 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mss51Q9D5Z5 446 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DnpepQ9Z2W0 473 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Itga8A2ARA8 1062 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnt2D3Z649 1135 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kctd18E0CZ26 429 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr694K7N641 315 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rag1P15919 1040 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PcnaP17918 261 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bmp4P21275 408 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PnpP23492 289 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Psmb9P28076 219 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sox8Q04886 464 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klra8Q60682 266 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tshz2Q68FE9 1030 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dalrd3Q6PJN8 538 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cnksr3Q8BMA3 555 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abcg4Q91WA9 646 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dach2Q925Q8 634 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CenpnQ9CZW2 337 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl2a1Q9JHK0 228 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stk4Q9JI11 487 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Myo1cQ9WTI7 1063 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trim15G3UY57 292 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pms2P54279 859 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hpcal1P62748 193 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem120bQ3TA38 339 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kctd8Q50H33 476 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 EregQ61521 162 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nfe2l1Q61985 741 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem154Q8C4Q9 181 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fndc5Q8K4Z2 209 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Alg9Q8VDI9 611 aa11.15□□□□□ -0.62
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm7145A0A087WS64 360 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr611K7N609 323 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr612L7N462 323 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 H2-Q8P14430 326 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NrlP54846 237 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vsnl1P62761 191 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rrm2bQ6PEE3 351 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tecpr1Q80VP0 1166 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zdhhc19Q810M5 347 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Snrnp25Q8VIK1 123 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dpy30Q99LT0 99 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slamf8Q9D3G2 278 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smok2bQ9QYZ3 484 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smok2aQ9QYZ6 504 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm13119B1ARV5 481 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2b23E9Q593 491 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 UoxP25688 303 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PmlQ60953 885 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FdxrQ61578 494 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpsm1Q6IR34 673 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TbceQ8CIV8 524 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr615Q8VGY4 313 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mgat4dQ9D4R2 373 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr742A2RTP5 311 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm281D3Z1Y0 860 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Foxr1Q3UTB7 268 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ckap2lQ7TS74 745 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sel1l3Q80TS8 1137 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem161bQ8C2L6 487 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 St8sia6Q8K4T1 398 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prorsd1Q9D820 169 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem176aQ9DCS1 244 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rad9aQ9Z0F6 389 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm382B1AXN3 1250 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CenpcP49452 906 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ThraP63058 492 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rufy4Q3TYX8 563 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpd2Q64521 727 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GnasQ6R0H7 1133 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Elmo3Q8BYZ7 720 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo33Q8VE08 562 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Camk2gQ923T9 529 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trim33Q99PP7 1142 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9D2Q3 444 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TheglQ9DA15 459 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr706Q9EPF8 316 aa11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AccsA2AIG8 502 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms