RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0A0MRY4 1105 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 DFFAO00273 331 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNCP24863 283 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPKAPK2P49137 400 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR3DQ70Z44 454 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIL6Q8IXY8 311 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP52Q8N1V2 620 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA13Q96N96 652 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF103O00237 685 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF197O14709 1029 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP2K7O14733 419 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 MTSS1O43312 755 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 STK10O94804 968 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM217AQ8IXS0 508 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NAT8LQ8N9F0 302 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-215ENST00000628018 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK1O00180 336 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 MAFKO60675 156 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SASH3O75995 380 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH4P55283 916 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 HOOK3Q86VS8 718 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAPO00193 183 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 LEFTY2O00292 366 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 GFRA2O00451 464 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 OPHN1O60890 802 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 PPFIA2O75334 1257 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN3P26045 913 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1E1P30953 314 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 AVPR1AP37288 418 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SGSHP51688 502 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS24P62847 133 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 BASP1P80723 227 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF567Q8N184 647 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 PIDD1Q9HB75 910 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB6BQ9NRW1 208 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 RASA4BC9J798 803 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 RASA4O43374 803 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN11O75508 207 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL18O95568 372 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CHKAP35790 457 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD22Q5VYY1 191 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST9Q7L1S5 443 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 VAT1Q99536 393 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP42A6NI28 874 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CHADO15335 359 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN3O60637 253 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 RAMP2O60895 175 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA6P43360 314 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ11Q14654 390 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 PARP15Q460N3 678 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 HMCESQ96FZ2 354 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP41Q9BYV8 373 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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