RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CDH18Q13634 790 aa8.75□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 TAZQ16635 292 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 NLRP14Q86W24 1093 aa8.75□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf40Q86WS4 652 aa8.75□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 TUBB4AP04350 444 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 ADCY2Q08462 1091 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC181Q5TID7 509 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 GJD3Q8N144 294 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 NPWQ8N729 165 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 PLD5Q8N7P1 536 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 FIBINQ8TAL6 211 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 HAUS1Q96CS2 278 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 DONSONQ9NYP3 566 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.74□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.74□□□□□ -1.01
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 RAMP2O60895 175 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 TULP3O75386 442 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 MAP3K6O95382 1288 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 FGGP02679 453 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 CISD3P0C7P0 127 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 PRLRP16471 622 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 TGM2P21980 687 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-FP30511 346 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 OPRD1P41143 372 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 CSKP41240 450 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 NDST2P52849 883 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 AMPD2Q01433 879 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 GNA12Q03113 381 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 GBE1Q04446 702 aa8.73□□□□□ -1.01
SGMS1-211ENST00000626236 LMAN2Q12907 356 aa8.73□□□□□ -1.01
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