RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 CETPP11597 493 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 LINC00310P59036 64 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 HSD11B2P80365 405 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 TAP2Q03519 686 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 MESP2Q0VG99 397 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 SPP2Q13103 211 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CRHR2Q13324 411 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CCNIQ14094 377 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CSHL1Q14406 222 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ANKRD1Q15327 319 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 SBK1Q52WX2 424 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ACER1Q8TDN7 264 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 HMGB4Q8WW32 186 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 NEU1Q99519 415 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 TTPALQ9BTX7 342 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 IL25Q9H293 177 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 VPS51Q9UID3 782 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 KCND3Q9UK17 655 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 AK9Q5TCS8 1911 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.5□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 FOCADQ5VW36 1801 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 A0A1W2PRG0 241 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CCDC78A2IDD5 438 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 A6NCN8 305 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 F5H697 171 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 LEFTY2O00292 366 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 FIBPO43427 364 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 NOBOXO60393 691 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 GPANK1O95872 356 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 KRT1P04264 644 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ASNSP08243 561 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 C1QTNF9P0C862 333 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 FGFR4P22455 802 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 KCNC1P48547 511 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 NDUFV1P49821 464 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 GATMP50440 423 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 P3H1Q32P28 736 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 METRNLQ641Q3 311 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ATG16L1Q676U5 607 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 RINLQ6ZS11 566 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 BBS12Q6ZW61 710 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ST8SIA4Q92187 359 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 MIEF2Q96C03 454 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 GNRHR2Q96P88 292 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CD320Q9NPF0 282 aa6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 KIF28PB7ZC32 967 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 PDHXO00330 501 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 DHHO43323 396 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 TLR2O60603 784 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CER1O95813 267 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 AKR1B1P15121 316 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 RBL1P28749 1068 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ADORA2AP29274 412 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CTGFP29279 349 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CD6P30203 668 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 UQCRC1P31930 480 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 MCM2P49736 904 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 HMGCS2P54868 508 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 CASP6P55212 293 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 BACE1P56817 501 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 FOXL1Q12952 345 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 PRKG2Q13237 762 aa6.48□□□□□ -1.37
ATRX-210ENST00000623316 ALX1Q15699 326 aa6.48□□□□□ -1.37
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