RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC157Q569K6 752 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 MED15Q96RN5 788 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 THAP9Q9H5L6 903 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PR77 199 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 WNT9AO14904 365 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 CD38P28907 300 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 STK19P49842 368 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ADPRHP54922 357 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 CYP4F3Q08477 520 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SLC12A1Q13621 1099 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 MORC3Q14149 939 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SHBQ15464 509 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS13Q6UX07 377 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 GATAD2AQ86YP4 633 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SCUBE2Q9NQ36 999 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.716e-6■■□□□ 12.8
PTPRF-216ENST00000617451 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 KCNU1A8MYU2 1149 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 F5H5T6 163 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ACAP1Q15027 740 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 OR14C36Q8NHC7 312 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SAP25Q8TEE9 199 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ACP6Q9NPH0 428 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 IL1BP01584 269 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 VAV1P15498 845 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 NNMTP40261 264 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 PLK1P53350 603 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 STX17P56962 302 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SULT2A1Q06520 285 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 TAF5Q15542 800 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SERAC1Q96JX3 654 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 GDF3Q9NR23 364 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 THAP12O43422 761 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 LATO43561 262 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ITGAVP06756 1048 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PDGFRAP16234 1089 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ABCB4P21439 1286 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 GNA15P30679 374 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 DRD3P35462 400 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PAK1Q13153 545 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PDCLQ13371 301 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS12Q86WS5 348 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FRS2Q8WU20 508 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FAM131CQ96AQ9 280 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GVM2 712 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TLR4O00206 839 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 ENC1O14682 589 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 YKT6O15498 198 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A3P11169 496 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 NUMBP49757 651 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 SPAG5Q96R06 1193 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3EA0A087X179 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3LB9A6J9 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 E9PAM4 449 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 BIN1O00499 593 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 GLI1P08151 1106 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3HP0C7X1 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CCR1P32246 355 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 VASPP50552 380 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 METAP1P53582 386 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 OXCT1P55809 520 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 NXPH1P58417 271 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2CBP62714 309 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2CAP67775 309 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 CDK17Q00537 523 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RABGAP1LQ5R372 815 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRF-216ENST00000617451 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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