RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 FYNP06241 537 aa20.54■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 DLG4P78352 724 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 NAB1Q13506 487 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 A0A096LPK6 155 aa20.54■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 CCT8P50990 548 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 KLC1Q07866 573 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.54■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.54■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 NUDT14O95848 222 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 OPTCQ9UBM4 332 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.52■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 VAC14Q08AM6 782 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.52■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 GLUD1P00367 558 aa20.52■□□□□ 0.88
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CTDP1-208ENST00000613122 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.52■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM13O60858 407 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 ELNP15502 786 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 TNFSF9P41273 254 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 IL2P60568 153 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 PFKPQ01813 784 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 GNA13Q14344 377 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.52■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.52■□□□□ 0.87
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